La CIE permet d'identifier physiquement le titulaire de façon sure grâce à la vérification des données personnelles et biométriques stockées à l'intérieur de la puce et protégées selon les mécanismes de sécurité prévus par les recommandations de l'ICAO 9303, soit les mêmes que celles régissant la délivrance du passeport électronique et le titre de séjour électronique. Grâce à cette compatibilité, la CIE peut être utilisée pour vérifier l'identité physique du titulaire avec les mêmes systèmes de contrôle que ceux utilisés pour le passeport aux postes frontières.
Grâce à l'application IDEA (Identity Easy Access) , il est possible de vérifier l'authenticité des documents électroniques en utilisant un smartphone avec système d'exploitation Android muni de la technologie NFC (Near Field Communication).
La vérification de l'identité physique d'un citoyen ayant demandé une CIE mais qui ne l'a pas encore en main, peut être effectuée grâce au récépissé de demande délivré par la commune. Le récépissé a valeur de pièce d'identité jusqu'à la veille de la date de délivrance de la Carte d’Identité Électronique .
La vérification du document provisoire et de l'état de traitement de la CIE peut être effectuée en scannant le QRCode figurant sur le récépissé avec l'application Ve.Do..